分类 生信 下的文章

HiC-Pro是一个成熟的Hi-C数据处理软件,负责从原始测序(FASTQ)到互作矩阵(contact maps)的一整套处理:mapping、过滤、fragment分配、生成validPairs、矩阵构建、质量控制等。它还包含多个实用脚本(utilities),用于downstream可视化或特定分析。make_viewpoints.py是一个轻量、直接把HiC-Pro的validPairs汇总为viewpoint-centric bedGraph(virtual-4C)的工具。

- 阅读剩余部分 -